细胞质是一种牛透明的胶状物质，其中含有细胞器和包含物。细胞器和包含物虽然都在细胞质内，但是它们的形态、结构和机能各不相同。细胞器是细胞质特殊分化的部分，其有一定的形态和结构，对细胞的生命活动起着重要作用。在电子显微镜观察时主要有内质网、线粒体、高尔基氏体、溶酶体和中心体等。
1.内质网，只有在电子显微既下才能看到，它是一种呈小管状或粪泡状的膜性结构（见图)，互相联络成网。根据内质网膜表面是否附有核蛋白体，将内质网分为两种：
(1）粗面内质网：在膜表面附有由蛋白质及核糖核酸组成的球形小体，叫核蛋白体。细胞合成蛋白质主要在此进行，合成的蛋白质进入内质网内腔野存，再运到高尔基氏体形成分泌颗粒，排到细胞外。
(2）滑面内质网：膜表面无核蛋白体，滑面内质网多存在于肝细胞、肾上腺皮质细胞、卵巢黄体细胞及睾丸间质细胞内，它与类脂质及固醇类激素的合成有关。
2．线粒体：除成熟的红细胞外，所有细胞都有线粒体，普通显微镜下为线状、粒状，电子显微镜下为大小不等的椭圆形小体，由两层膜构成，内层膜向内形成许多略。线粒体内含有许多氧化雨和磷酸化酶，能把细胞内已初步分解的物质继续进行氧化分解，从而产生能量以供细胞的活动，因此它是细胞的动力站。
3．高尔基氏体。在电子显微镜下观察由扁平的乳、泡等组成，由粗面内质网形成的蛋白质运到这里，经过浓缩加工，形成分泌颗粒，排到细胞外，因此高尔基氏体与分泌颗粒的形成有关。
4．溶酶体：电子显微镜下呈大小不等的囊泡状小体，其中含有多种水解酶（如酸性磷酸酶等)，能把进入细胞内的异物或大分子物质进行消化分解。如中性白细胞内的特殊颗粒就是一种较大的溶酶体。
5．中心体，由中心粒和中心球组成。细胞的纤毛或鞭毛是由中心体形成的。在细胞分裂时中心体形成两个纺锤体，将染色体引向两极，有利于细胞分裂。
包含物是细胞质内暂时储存的营养物质或代谢产物，常随细胞的种类、发育程度和生理状态而有所不同，它并不普温存在于所有细胞内，常见的包含物有糖元颗粒、脂肪两、分泌颗粒和色素颗粒等。
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