普通尿细菌学检查包括直接涂片及细菌培养。直接涂片可以明确细菌为革兰氏阳性菌或革兰氏阴性菌感染,并且通过特殊染色或根据细菌特殊形态初步明确细菌的类型,如结核杆菌、淋病双球菌。尿细菌定量培养凡细菌数大于10万为感染;小于1千或有多种细菌生长,为污染;1千至10万之间应当结合临床其他结果判断,必要时复查或采用特殊培养基进行培养(高渗培养、结核杆菌培养、厌氧菌培养、真菌培养)。尿培养除了清洁外阴后留取中段尿外,可以导尿或耻骨上穿刺收集无菌尿,另外输尿管插管可以留取分侧的尿分别进行培养。
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